Coronavirus på närmare håll

I traditionell mening lever inte virus, de kan inte bestå på längre sikt eller föröka sig utan en värd. Det fungerar ungefär som en ganska tillfällig påse innehållande en genetisk kod samt med hakar på utsidan som fastnar på värdceller.

Ytterligare info om hur länge virus är aktiva utanför värdorganismer. https://www.journalofhospitalinfection.com/article/S0195-6701(20)30046-3/fulltext

Virusets hölje är av allra enklaste slag, ett enkelt lipidlager, alltså fettsyror. [3] Löser vi upp virusets hölje spiller innehållet ut och blir ofarligt. Gör det med något fettlösande, tvätta med tvål eller alkohol. Märkvärdigare än så behöver det inte vara.

Höljet vi bryter sönder med tvål eller koncentrerad alkohol är det som kallas envelope i bilden. Virusets två viktigaste delar är ‘Spike Glycoprotein‘ som omger det och söker närkontakt med våra celler samt den spiralformade genetiska koden, RNA [4]

På tvådimensionella bilder omges coronavirus av något som ser ut som en krona vilket gett dess namn. I den tredimensionella världen finns dessa Spike Proteins överallt på ytan vilket dramatiskt ökar dess chans att haka fast i våra celler. Jag vet inte med säkerhet vad de greppar tag i men denna bild föreslår Angiotensin Converting Enzyme 2 Receptor (ACE2 [7]) som finns i alveolerna (blåsorna längst in i lungorna). Mekanismen är inte helt känd men troligen samma som för SARS (2002) och enligt min källa (se längst ner) är endocytos [4] ett alternativ, cellmembranet kröker sig runt viruset och bildar en bubbla som dras in i cellen.

Våra celler är tillitsfulla, närmast korkade. De saknar källkritik och kollar inte upp om ett RNA-meddelande är rimligt eller ej, de utför arbetsordern. Den är väldigt enkel, gör mängder av viruset. (Jo, jag vet att det är mer invecklat än så.) Värdcellen börjar exportera virus via exocytos [4] men till slut kickar apoptos [5] (programmerad celldöd, självdestruktion då cellen slutligen upptäcker att den är lurad) igång, cellen dör och innehållet spills ut. Det är den ‘enkla’ metod som icke levande virus använder för att föröka sig.

Bilden nedan delar upp förloppet i olika stadier och ger intryck av att de är tydligt åtskilda, något jag starkt betvivlar. Inte heller litar jag på hur länge de olika stadierna varar. Min uppfattning är att inkubationsperioden, den tid viruset använder som startsträcka, redan tidigt också innebär att man kan överföra smitta till andra. Detta då den relativt lugna exocytosen kan leverera tillräckligt med virus att hamna i utandningsluften och smitta andra. Det akuta sjukdomsförloppet börjar när apoptosen tar fart, vräker ut nya virus och dessutom engagerar kroppen i jobbet att ta hand om döda celler. Detta skapar inflammation som hindrar gasutbyte (syre och koldioxid) och gör att vätska läcker in och fyller upp alveolerna.

Detta kan/kommer att ändras och kompletteras över tid. Jag tar gärna emot synpunkter och förslag, gärna av läkare, till erik.matfrisk@gmail.com


[1] Kroppens cellmembran är dubbla lager av fosfolipider med lipidändarna (‘fett’) vända inåt mot varandra. De är långtidsstabila, tåliga och täta mot det mesta utom syre, koldioxid och vatten. För övriga ämnen till och från finns dels specialiserade transportörer samt några trick.

[2] Lipidlagren i människans cellmembran samt lipoproteiner (LDL, HDL och liknande som felaktigt kallas ‘kolesterol’) består av två fettsyror samt en fosfogrupp. Det senare kan ‘umgås’ med vatten (hydrofil) och sina likar medan fettsyrorna är lipofila, umgås med fetter. Dessa membran får automatiskt en hydrofil och en lipofil sida.

[3] En fettsyra har en metyl– och en karboxylände. Den förra inklusive resten av kolkedjan ger fettegenskaper medan karboxyländen har en OH-grupp som kopplar till andra ämnen inklusive vatten.

[4] Jag har tidigare skrivit om olika metoder som våra celler använder för utbyte med omgivningen. https://matfrisk.com/2016/10/12/hur-ater-och-dricker-celler/

[5] Apoptos beskrivet i ett annat sammanhang: https://matfrisk.com/2015/05/12/programmerad-celldod-och-cancer/

[6] Vår genetiska kod kallas DNA och finns i alla celler. Det är en lång dubbelspiral uppbyggd av fyra ‘bokstäver’ och finns inne i cellkärnan. Den dubbla formen ökar sannolikheten för att skador (‘fel’) ska upptäckas i tid och repareras. När proteiner produceras i cellen går frågan först till DNA som levererar en enkel RNA-slinga (‘hålkort’) som forslas till produktionsplatsen.

[7] ACE-hämmare (ex. Enalapril) används som blodtryckssänkande medel. En vanlig biverkan är hosta.

Forskningen går på högvarv och kunskapen har alldeles säkert nått längre än denna animerade version: https://youtu.be/I-Yd-_XIWJg

Sverige verkar göra något rätt

Svensk Farmaci: https://svenskfarmaci.se/noterat/sverige-verkar-gora-nagot-ratt/

De som vill ”sitta lugnt i båten” har tur om de åker i en svensk med roddare, ösare och navigatörer. Den spanska är ett klart sämre val till och med i jämförelse med Italien.

Rådata från Johns Hopkins

Glaciärer förr och nyligen (2015-16)

Is som vilar på land och smälter bidrar till delar av havsvattenhöjningen. Smältning eller tillväxt är resultat av väder som i förlängningen summerar till klimat.

Time-lapse photo couplets of glaciers revealing retreat.

(A–B) Mendenhall Glacier, Alaska, retreat of ~550 m from 2007 to 2015.

(C–D) Solheimajokull, Iceland, retreat of ~625 m from 2007 to 2015.

(E–F) Stein Glacier, Switzerland, retreat of ~550 m from 2006 to 2015.

(G–H) Trift Glacier, Switzerland, retreat of ~1.17 km from 2006 to 2015.

(I–J) Qori Kalis Glacier, an outlet of the Quelccaya Ice Cap, Peru, retreat of ~1.14 km from 1978 to 2016.

Photo credits: (A–H) James Balog and the Extreme Ice Survey; (I–J) Lonnie Thompson.


https://www.geosociety.org/gsatoday/science/G293A/figure/f02.htm

Att bygga en matematisk modell

Matematik är ett ”språk” som kan användas för att beskriva, förutsäga och därmed modellera framtida utveckling givet ett antal kända och/eller antagna parametrar. Utvecklingen av coronaviruset är i Tom Brittons fokus men han berör även mässling,

Jag kan inte frigöra mig från tanken att den matematiska modellen kan beskriva utvecklingen av kedjebrev, konspirationer och liknande. Där skulle en god grundläggande skolgång fungera som ett mentalt immunförsvar [1] medan en eller flera obehandlade ‘infektioner’ ökar sannolikheten [2] för spridning till riskgrupper med undermålig källkritik.

Professor Tom Britton, Stockholms Universitet


[1] Kallas negativ återkoppling som dämpar ett förlopp.

[2] Positiv återkoppling förstärker ett förlopp som t.ex. tjutet som kan uppstå när en mikrofon plockar upp ljudet via högtalarna.

Kittla barns nyfikenhet!

Människors spontana inlärningstopp är under barndom och ungdomsår. De som då stimuleras inom ett eller flera fält kan förhoppningsvis ha nytta av det fortsättningsvis.

Få har förmånen av att ha eller upplevt lärare med pedagogisk förmåga ens i nivå Bruce Yeaney [1]


[1] Idag har han 177 videor och 231 000 prenumeranter på YouTube

Väderstatistik för Europa och Världen

Bilden visar en av elva grafer från C3S. [1]

Bilderna visar anomalier, avvikelser från perioden 1981-2010.

Winter 2019/2020 in Europe saw generally wetter than average conditions across most of western and northern Europe, with above average precipitation and above average soil moisture. Western Norway saw much above average precipitation, due to sustained high amounts of rainfall throughout the period, in particular during January and February. The southern and eastern parts saw generally drier than average conditions, especially so for soil moisture in the southern Iberian Peninsula, most of the regions adjacent to the Adriatic Sea, and over a large region to encompassing the Black Sea from west to east. Temperature was above average across the whole continent, especially so in the northeast.

Källa: https://climate.copernicus.eu/precipitation-relative-humidity-and-soil-moisture-february-2020

I norra Sverige har vi fått nederbörd i liknande utsträckning som under jämförelseperioden, kanske lite mer. Vi norrlänningar kan stötta övriga landet med elkraft även detta år. Markfuktigheten lite högre vilket bådar gott för grundvattnet, kanske ingen vattenbrist framöver. Södra Spanien, Italien, Grekland och Östeuropa ligger sämre till.


[1] Om Copernicus: https://climate.copernicus.eu/what-copernicus