Etikett: SARS-Cov-2

Vacciner mot Corona

Tillfogat 210114: En kort video som beskriver olika typer av vacciner https://youtu.be/lFjIVIIcCvc

Corona och dess bekämpning har gått in i en ny fas. Västerbottens-Kuriren (210111) har en intressant artikel [1] som förklarar likheter och skillnader mellan några vanliga vacciner.

Vaccinering kan liknas vid utbildning och träning av vårt immunförsvar så att det står redo inför eventuellt ”skarpt läge”. Det hittillsvarande sättet har varit att spruta in en oskadliggjord form av viruset som immunförsvaret kan lära sig att känna igen och attackera.

För att möjliggöra snabb framtagning av vaccin, samtidigt oförmöget att sprida sjukdomen vidare, använder Pfizer/Biontech, Moderna och Astra Zeneca andra sätt. Immunförsvaret behöver inte ett helt virus för att identifiera och reagera, det räcker med en del. Dessa vacciner innehåller ett par begränsade delar av den genetiska koden från SARS-CoV-2.

DNA är information i form av den välkända dubbelspiralen, finns i cellkärnan och omfattar organismens kompletta arvsmassa. Den utgör ett slags referensbibliotek för allt som behöver skapas. Vid behov bildas en arbetskopia av rätt avsnitt i form av en enkel slinga, RNA. Det lämnar cellkärnans skyddade miljö och går till det maskineri som tillverkar det protein som efterfrågas.

I detta sammanhang skapas en tillräckligt stor del av spikeprotein som ger SARS-CoV-2 dess karakteristiska gloria (Corona). Immunförsvaret uppfattar det som främmande, inleder bekämpning och bildar antikroppar för framtida behov.

Pfizer/Biontech och Moderna använder messenger-RNA där det räcker att mRNA hamnar i cellens ”verkstad”, cytoplasma, där tillverkningen av ”fakeproteinet” sker. mRNA är en bräcklig engångskod som förstörs efter användning, den kan därför inte påverka arvsmassan. Detta är också en nackdel som man motverkar genom att förvara dem i stark kyla, minus 70C för Pfizer/Biotech, minus 20C för Moderna.

Astra Zeneca använder ett utsnitt av en dubbelspiral som kännetecknar DNA. Den är robustare och kan därför förvaras i kylskåpstemperaturer. Å andra sidan måste den transporteras in i cellkärnan för att där avkodas till RNA. För det använder man en Trojansk häst i form av ett adenovirus från schimpans som rensats på sitt genetiska material och fylls med fakeDNA. Väl på plats avkodas detta fakeDNA till fakeRNA som exporteras till cytoplasman.

FakeDNA skvalpar omkring en stund i cellkärnan och blir aldrig en del av dess eget DNA. Dessutom kommer cellen med sitt innehåll av främmande protein att angripas och brytas ner av immunförsvaret. Nackdelen med DNA-metoden är att immunförsvaret kan utveckla immunitet mot transportviruset och sänka effektiviteten.

Tillfogat 210114: En kort video som beskriver olika typer av vacciner https://youtu.be/lFjIVIIcCvc

[1] Har du lånekort på bibliotek ökar chansen att du kan läsa tidningar och tidskrifter via webben, försök.

Hur motverka smittspridning

Matematik och statistik används i den länkade videon för att spegla resultaten av åtgärder som minskar smittspridning mellan personer som interagerar med varandra.

Den länkade videon exemplifierar med användning av ansiktsmasker. Om du väljer en eller flera metod(er) som minskar risken för smittspridning från och till dig, hur blir effekten i samhället om andra också är lika kloka som du?

Länk till en interaktiv sajt där du själv kan experimentera med olika parametrar: https://aatishb.com/maskmath/

Spridning, med och utan mask

Om du har bråttom, läs åtminstone i rutan nere till höger innan du klickar igång videon.

Sometimes having a visual is the best way to understand something. This is particularly true when it comes to science. And as wearing a face mask has become part of our daily routine, more and more people are questioning if it really matters. As summer sets in and heats up, how much will wearing another layer across your face really protect you? One microbiologist took matters into his own hands to show just what happens when you stay covered up.

Dr. Richard Davis is the Clinical Microbiology Lab Director at Providence Sacred Heart Medical Center in Spokane, Washington. After seeing a lot of misinformation about the dangers and usefulness of face masks, he decided to do a demonstration.

In the first demo, he placed agar cultures close to his face to show how many respiratory particles transferred while talking, singing, sneezing, and coughing with and without a face mask. The results are clear. Just one sneeze without a mask fills the culture with bacteria colonies that form where the respiratory droplets fell. Coughing gave a similar effect and even singing and talking for one minute caused bacteria transfer. Meanwhile, the masked cultures were basically clean.

For the second demonstration, Dr. Davis looked at distance, as this is the other common method of keeping the coronavirus from spreading. Placing bacteria culture plates two, four, and six feet away, he coughed hard for about 15 seconds both with and without a mask. Again, the results are clearly in favor of a face mask. While most droplets hit the plate when he was less than six feet away, a face mask blocked nearly all of them—no matter the distance.

Källa: https://mymodernmet.com/face-mask-demo/

Väder, sol och virus

Sunlight destroys coronavirus quickly, say US scientists

https://news.yahoo.com/sunlight-destroys-coronavirus-quickly-us-scientists-082536009.html

En ännu ej publicerad rapport sägs komma med hoppfulla besked om minskad spridning av SARS-Cov-2 (‘Coronaviruset’) under sommaren.

The new coronavirus is quickly destroyed by sunlight, according to new research announced by a senior US official on Thursday, though the study has not yet been made public and awaits external evaluation.

Viruset SARS-Cov-2 omges av ett lipidlager (fettsyror) genom vilket ‘spikes’ sticker ut och binder till ett protein (ACE2) på mänskliga celler, främst i luftstrupe och lungor. [1]

Bild tagen med elektronmikroskop. De kronliknande strukturerna på ytan häftar mot ACE2 på mänskliga celler.

”Our most striking observation to date is the powerful effect that solar light appears to have on killing the virus, both surfaces and in the air,” he said.

I linje med hittillsvarande antaganden fann man att solljus samt högre fukt och värme deaktiverar viruset.

”We’ve seen a similar effect with both temperature and humidity as well, where increasing the temperature and humidity or both is generally less favorable to the virus.”

Då rapporten ännu ej publicerats har inga oberoende experter granskat de använda metoderna och data.

It has long been known that ultraviolet light has a sterilizing effect, because the radiation damages the virus’s genetic material and their ability to replicate.

A key question, however, will be what the intensity and wavelength of the UV light used in the experiment was and whether this accurately mimics natural light conditions in summer.

UV-strålning delas in i tre typer, A, B och C. Bara A och i någon mån B når ner genom atmosfären till havsytans nivå medan C hindras högt upp i atmosfären. [2] UV-B är kortvågigare, har energi nog att ge brännskador på huden om vi solar för länge.

När vi solar ‘lagom’ bildas hormonet D-vitamin i huden där molekylen kolesterol [3] är grundråvaran. En förutsättning är att och solen når >45° över horisonten då UV-strålning dämpas ju längre den färdas i atmosfären.

Under presentationen visades en bild över virusets halveringstid.

It showed that the virus’s half-life — the time taken for it to reduce to half its amount — was 18 hours when the temperature was 70 to 75 degrees Fahrenheit (21 to 24 degrees Celsius) with 20 percent humidity on a non-porous surface.

This includes things like door handles and stainless steel.

But the half-life dropped to six hours when humidity rose to 80 percent — and to just two minutes when sunlight was added to the equation.

When the virus was aerosolized — meaning suspended in the air — the half-life was one hour when the temperature was 70 to 75 degrees with 20 percent humidity.

Det ser ju hoppfullt ut men det förutsätter att tillräckligt starkt UV-ljus når ‘alla’ ytor! Det är till ingen nytta på undersidan av dörrhandtaget eller om det ligger i skugga.

Bryan concluded that summer-like conditions ”will create an environment (where) transmission can be decreased.”

Inget av detta är nyskapande eller kontroversiellt. Att man gjorde denna presentation i Vita Huset har nog sina randiga och rutiga skäl. Det faller sannolikt Donald Trump i smaken och genererar finansiering.

He added, though, that reduced spread did not mean the pathogen would be eliminated entirely and social distancing guidelines cannot be fully lifted.

”It would be irresponsible for us to say that we feel that the summer is just going to totally kill the virus and then if it’s a free-for-all and that people ignore those guides,” he said.

Australien är känt för värme och så starkt solsken att man sommartid ständigt måste skydda sig. När detta skrivs har man bara 7000 bekräftade fall och 77 döda till följd av Covid-19.

US health authorities believe that even if COVID-19 cases slow over summer, the rate of infection is likely to increase again in fall and winter, in line with other seasonal viruses like the flu.

Om naturen hindrar spridningen av SARS-Cov-2 med behagligt sommarväder är det tilltalande men när hösten kommer är de ännu ej immuniserade lika känsliga som nu.

[1] SARS-CoV-2 spikes bind to receptors on the human cell surface called angiotensin-converting enzyme 2 (ACE2) https://www.nih.gov/news-events/nih-research-matters/novel-coronavirus-structure-reveals-targets-vaccines-treatments

[2] Detta liknar växthuseffekten där utgående IR-strålning absorberas och reflekteras av atmosfären.

[3] Märk väl att detta är molekylen kolesterol, inte någon av de olika lipoproteinerna (LDL av olika fraktioner) som du varnas för.